保护机制是确保城市和资源安全的核心策略其中一个。合理利用保护可以有效避免被敌方突袭，尤其是在离线或资源积累阶段。保护分为城市保护和部队保护两种形式，城市保护通过开始护盾防止建筑被攻击，而部队保护则需要依靠合理的布防和补给线维持战斗力。需护盾持续时刻有限且需要消耗特定资源，因此必须根据战场形势和资源储备进行规划。

开始城市保护前需确保资源充足，尤其是钢铁和石油的库存，由于这些是维持护盾的基础材料。护盾激活期间，敌方无法直接攻击城市建筑，但部队若在城外仍也许遭遇伏击。因此提议在开始护盾前将主力部队撤回城内，或派遣至安全区域驻防。护盾的持续时刻和城市等级相关，顶级城市可延长保护时刻，但需提前更新主城和商业区以提高资源转换效率。

任何脱离补给范围的部队都会逐渐损失兵力，尤其是陆军部队缺乏食物或燃料时将无法行动。远征前必须确保目标区域在补给范围内，或提前建立中转站。空军部队虽不受地形限制，但同样依赖补给品厂的弹药和燃料支持。若规划长期作战，可优先更新补给品厂并研发空投补给策略，以延长部队的持续作战能力。